Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UTRNP46939 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UTRNP46939 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UTRNP46939 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UTRNP46939 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UTRNP46939 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UTRNP46939 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UTRNP46939 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UTRNP46939 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UTRNP46939 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UTRNP46939 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UTRNP46939 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UTRNP46939 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UTRNP46939 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UTRNP46939 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UTRNP46939 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UTRNP46939 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UTRNP46939 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UTRNP46939 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UTRNP46939 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UTRNP46939 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UTRNP46939 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UTRNP46939 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UTRNP46939 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
UTRNP46939 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UTRNP46939 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UTRNP46939 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UTRNP46939 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UTRNP46939 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UTRNP46939 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UTRNP46939 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UTRNP46939 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UTRNP46939 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UTRNP46939 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UTRNP46939 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UTRNP46939 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UTRNP46939 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UTRNP46939 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UTRNP46939 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UTRNP46939 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UTRNP46939 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UTRNP46939 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UTRNP46939 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UTRNP46939 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UTRNP46939 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UTRNP46939 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UTRNP46939 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UTRNP46939 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UTRNP46939 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UTRNP46939 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UTRNP46939 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
UTRNP46939 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UTRNP46939 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UTRNP46939 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UTRNP46939 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UTRNP46939 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UTRNP46939 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UTRNP46939 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UTRNP46939 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UTRNP46939 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UTRNP46939 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UTRNP46939 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms