Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL3P36405 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARL3P36405 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARL3P36405 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL3P36405 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL3P36405 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL3P36405 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL3P36405 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARL3P36405 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARL3P36405 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARL3P36405 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARL3P36405 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARL3P36405 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARL3P36405 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARL3P36405 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms