Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF2E1P29083 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2E1P29083 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GTF2E1P29083 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms