Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC5P28715 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERCC5P28715 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC5P28715 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms