Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDCP20941 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCP20941 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCP20941 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCP20941 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCP20941 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCP20941 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCP20941 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCP20941 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCP20941 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCP20941 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCP20941 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCP20941 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCP20941 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCP20941 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCP20941 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCP20941 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCP20941 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCP20941 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCP20941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCP20941 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCP20941 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCP20941 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCP20941 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCP20941 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCP20941 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCP20941 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCP20941 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCP20941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDCP20941 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCP20941 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms