Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDSP20132 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SDSP20132 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SDSP20132 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SDSP20132 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SDSP20132 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SDSP20132 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SDSP20132 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SDSP20132 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDSP20132 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDSP20132 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDSP20132 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDSP20132 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDSP20132 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SDSP20132 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDSP20132 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SDSP20132 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDSP20132 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDSP20132 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDSP20132 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDSP20132 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDSP20132 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDSP20132 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDSP20132 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDSP20132 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDSP20132 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDSP20132 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDSP20132 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDSP20132 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDSP20132 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDSP20132 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDSP20132 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDSP20132 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDSP20132 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDSP20132 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDSP20132 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDSP20132 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDSP20132 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDSP20132 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDSP20132 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDSP20132 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDSP20132 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms