Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD58P19256 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CD58P19256 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD58P19256 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD58P19256 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD58P19256 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD58P19256 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD58P19256 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD58P19256 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD58P19256 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD58P19256 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD58P19256 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD58P19256 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD58P19256 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD58P19256 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD58P19256 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD58P19256 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD58P19256 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD58P19256 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD58P19256 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD58P19256 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD58P19256 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD58P19256 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD58P19256 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD58P19256 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD58P19256 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD58P19256 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD58P19256 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD58P19256 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD58P19256 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD58P19256 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD58P19256 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD58P19256 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD58P19256 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD58P19256 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD58P19256 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD58P19256 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD58P19256 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD58P19256 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD58P19256 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD58P19256 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms