Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFXP16104 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFXP16104 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFXP16104 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms