Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDP15428 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDP15428 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDP15428 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDP15428 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDP15428 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDP15428 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDP15428 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDP15428 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDP15428 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDP15428 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDP15428 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDP15428 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDP15428 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDP15428 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDP15428 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDP15428 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDP15428 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms