Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNAP12004 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNAP12004 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNAP12004 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNAP12004 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNAP12004 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNAP12004 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNAP12004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNAP12004 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNAP12004 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNAP12004 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNAP12004 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNAP12004 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNAP12004 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCNAP12004 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCNAP12004 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNAP12004 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNAP12004 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms