Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD1P11586 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFD1P11586 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms