Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETSIPP0DME0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETSIPP0DME0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETSIPP0DME0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETSIPP0DME0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms