Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 PIF1YML061C 2580 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 HXT15YDL245C 1704 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 HXT16YJR158W 1704 nt7.44□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 SSK1YLR006C 2139 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 ATP1YBL099W 1638 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 NMA1YLR328W 1206 nt7.43□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 APS1YLR170C 471 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 YLR317WYLR317W 435 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 CIN5YOR028C 888 nt7.42□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 QDR1YIL120W 1692 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 HEM3YDL205C 984 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 REI1YBR267W 1182 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 UTP18YJL069C 1785 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 BUD16YEL029C 939 nt7.41□□□□□ -1.22
YRF1-8P0CX22 YNL174WYNL174W 573 nt7.4□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 PCL1YNL289W 840 nt7.4□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 RPS19BYNL302C 435 nt7.4□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 RFU1YLR073C 603 nt7.39□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 MDG1YNL173C 1101 nt7.39□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 SCO1YBR037C 888 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 HEM14YER014W 1620 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 IMA5YJL216C 1746 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 ATG20YDL113C 1923 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 GUA1YMR217W 1578 nt7.38□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 ATR1YML116W 1629 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 NAG1YGR031C-A 492 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 PSH1YOL054W 1221 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 NPT1YOR209C 1290 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 GAL2YLR081W 1725 nt7.37□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 NIT2YJL126W 924 nt7.36□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 TIP41YPR040W 1071 nt7.36□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 HRR25YPL204W 1485 nt7.36□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 YPL191CYPL191C 1083 nt7.36□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 YMR027WYMR027W 1413 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 FOX2YKR009C 2703 nt7.35□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 KIP2YPL155C 2121 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 YOL131WYOL131W 327 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 ECM23YPL021W 564 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 PDH1YPR002W 1551 nt7.34□□□□□ -1.23
YRF1-8P0CX22 NOP16YER002W 696 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 RGS2YOR107W 930 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SKY1YMR216C 2229 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 KTI12YKL110C 942 nt7.33□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 ABF1YKL112W 2196 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 ECM3YOR092W 1842 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SMF3YLR034C 1422 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 ERD1YDR414C 1089 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SWI3YJL176C 2478 nt7.32□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 UBC8YEL012W 657 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 IDP1YDL066W 1287 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SPR6YER115C 576 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SPL2YHR136C 447 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 YML057C-AYML057C-A 390 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 URE2YNL229C 1065 nt7.31□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 MMT2YPL224C 1455 nt7.3□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 CIA2YHR122W 696 nt7.29□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 ATG26YLR189C 3597 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SEC12YNR026C 1416 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 GEX1YCL073C 1848 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 GEX2YKR106W 1848 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 RFC2YJR068W 1062 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 SCW10YMR305C 1170 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-8P0CX22 THP1YOL072W 1368 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 MAG2YLR427W 2013 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 FUI1YBL042C 1920 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 PDI1YCL043C 1569 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 GPA1YHR005C 1419 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 GSP2YOR185C 663 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 STB5YHR178W 2232 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 FRT2YAL028W 1587 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 DPB4YDR121W 591 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YGL152CYGL152C 678 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YBL044WYBL044W 369 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 NGR1YBR212W 2019 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 SSH4YKL124W 1740 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 UGA2YBR006W 1494 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 TRM10YOL093W 882 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 HXT4YHR092C 1731 nt7.24□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YPR098CYPR098C 486 nt7.24□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 RCK1YGL158W 1539 nt7.24□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YOL075CYOL075C 3885 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 CTF3YLR381W 2202 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 HXT3YDR345C 1704 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 ARF2YDL137W 546 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 HIR1YBL008W 2523 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 FUN19YAL034C 1242 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 MRPL20YKR085C 588 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 MEU1YLR017W 1014 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 PGA2YNL149C 390 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YJR124CYJR124C 1347 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YNL040WYNL040W 1371 nt7.21□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 CTR2YHR175W 570 nt7.21□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 YML6YML025C 861 nt7.21□□□□□ -1.25
YRF1-8P0CX22 BSC5YNR069C 1470 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.7 ms