Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF888P0CJ79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF888P0CJ79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms