Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC159P0C7I6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC159P0C7I6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC159P0C7I6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.7 ms