Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS17P08708 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS17P08708 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS17P08708 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS17P08708 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS17P08708 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS17P08708 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS17P08708 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS17P08708 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS17P08708 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS17P08708 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS17P08708 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS17P08708 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS17P08708 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS17P08708 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS17P08708 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS17P08708 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS17P08708 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS17P08708 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS17P08708 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS17P08708 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS17P08708 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS17P08708 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms