Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB4AP04350 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB4AP04350 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4AP04350 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms