Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRB1P04280 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB1P04280 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRB1P04280 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRB1P04280 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRB1P04280 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB1P04280 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB1P04280 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB1P04280 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB1P04280 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRB1P04280 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRB1P04280 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRB1P04280 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRB1P04280 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRB1P04280 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRB1P04280 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRB1P04280 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRB1P04280 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRB1P04280 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRB1P04280 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRB1P04280 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRB1P04280 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRB1P04280 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRB1P04280 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRB1P04280 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRB1P04280 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRB1P04280 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRB1P04280 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB1P04280 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB1P04280 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB1P04280 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB1P04280 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRB1P04280 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRB1P04280 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRB1P04280 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms