Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf47O95873 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms