Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOO75962 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOO75962 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOO75962 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOO75962 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOO75962 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOO75962 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOO75962 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOO75962 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOO75962 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOO75962 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIOO75962 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIOO75962 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIOO75962 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIOO75962 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIOO75962 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIOO75962 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOO75962 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOO75962 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOO75962 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOO75962 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIOO75962 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIOO75962 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOO75962 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOO75962 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOO75962 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIOO75962 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIOO75962 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIOO75962 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIOO75962 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIOO75962 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOO75962 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOO75962 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOO75962 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOO75962 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIOO75962 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOO75962 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOO75962 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOO75962 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIOO75962 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOO75962 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOO75962 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOO75962 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOO75962 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOO75962 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOO75962 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOO75962 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOO75962 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOO75962 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms