Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3BO75182 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIN3BO75182 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3BO75182 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3BO75182 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms