Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNSO60931 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNSO60931 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNSO60931 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNSO60931 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNSO60931 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNSO60931 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNSO60931 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNSO60931 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNSO60931 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNSO60931 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNSO60931 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNSO60931 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNSO60931 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNSO60931 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNSO60931 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNSO60931 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNSO60931 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNSO60931 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNSO60931 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNSO60931 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNSO60931 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNSO60931 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNSO60931 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNSO60931 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms