Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN3O60664 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLIN3O60664 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms