Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX16O60231 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX16O60231 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX16O60231 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX16O60231 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX16O60231 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX16O60231 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX16O60231 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX16O60231 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX16O60231 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX16O60231 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX16O60231 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX16O60231 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX16O60231 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX16O60231 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX16O60231 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX16O60231 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX16O60231 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX16O60231 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DHX16O60231 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DHX16O60231 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DHX16O60231 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DHX16O60231 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX16O60231 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX16O60231 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX16O60231 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX16O60231 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX16O60231 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX16O60231 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX16O60231 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX16O60231 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX16O60231 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX16O60231 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX16O60231 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms