Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM8AO60220 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TIMM8AO60220 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TIMM8AO60220 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms