Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TO15178 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TO15178 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TO15178 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TO15178 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TO15178 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TO15178 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TO15178 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TO15178 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TO15178 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TO15178 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TO15178 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TO15178 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TO15178 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TO15178 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TO15178 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TO15178 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TO15178 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TO15178 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TO15178 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TO15178 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TO15178 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TO15178 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TO15178 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TO15178 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TO15178 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TO15178 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TO15178 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TO15178 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TO15178 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TO15178 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TO15178 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TO15178 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TO15178 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TO15178 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TO15178 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TO15178 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TO15178 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TO15178 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TO15178 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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