Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PQ18 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PQ18 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PQ18 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PQ18 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PQ18 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PQ18 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PQ18 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PQ18 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PQ18 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PQ18 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PQ18 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PQ18 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PQ18 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E9PQ18 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E9PQ18 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PQ18 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms