Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCRIP1C9JLW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms