Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HACD1B0YJ81 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACD1B0YJ81 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms