Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRR3A8MPY1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms