Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF860A6NHJ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF860A6NHJ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms