Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP73A6NFT4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms