Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0D9SFI3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0D9SFI3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0D9SFI3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0D9SFI3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms