Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
R4GMQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
R4GMQ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
R4GMQ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
R4GMQ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
R4GMQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
R4GMQ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R4GMQ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R4GMQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
R4GMQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
R4GMQ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
R4GMQ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R4GMQ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R4GMQ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R4GMQ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
R4GMQ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
R4GMQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
R4GMQ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
R4GMQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
R4GMQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
R4GMQ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R4GMQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R4GMQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms