Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIAS3Q9Y6X2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIAS3Q9Y6X2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIAS3Q9Y6X2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIAS3Q9Y6X2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms