Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHGB2Q9Y5G2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHGB2Q9Y5G2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms