Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHBDD3Q9Y3P4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDD3Q9Y3P4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms