Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP58Q9Y2X3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NOP58Q9Y2X3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP58Q9Y2X3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms