Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG6Q9Y2V7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
COG6Q9Y2V7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms