Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDCQ9Y266 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUDCQ9Y266 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDCQ9Y266 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335 ms