Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MED23Q9ULK4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms