Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PARP4Q9UKK3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PARP4Q9UKK3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PARP4Q9UKK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms