Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXW11Q9UKB1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW11Q9UKB1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXW11Q9UKB1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms