Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXD3Q9UJU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms