Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG2Q9UBF2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms