Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC88CQ9P219 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms