Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 54.18□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 CSNK2A2-202ENST00000562367 687 ntTSL 38.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 RELN-204ENST00000429186 891 ntTSL 58.01□□□□□ -1.135e-14■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 217.72■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC13.37□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-9■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 27.5
IGF2BP1Q9NZI8 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 27.4
IGF2BP1Q9NZI8 UBAP2L-217ENST00000489076 850 ntTSL 27.36□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 27.4
IGF2BP1Q9NZI8 CAPRIN1-206ENST00000528948 585 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-12■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNT1-202ENST00000417344 2017 ntTSL 26.67□□□□□ -1.349e-9■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.539e-9■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 IARS-207ENST00000467876 298 ntTSL 34.12□□□□□ -1.759e-9■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 229.29■■■□□ 2.281e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 21e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 EIF4A1-210ENST00000578569 583 ntTSL 27.11□□□□□ -1.271e-19■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 35.75□□□□□ -1.493e-8■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 27.3
IGF2BP1Q9NZI8 UBE2L3-203ENST00000496722 3451 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM135-205ENST00000528861 1146 ntTSL 35.95□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.159e-9■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.81■□□□□ 0.769e-9■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.689e-9■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.619e-9■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 517.72■□□□□ 0.439e-9■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.28e-8■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.181e-8■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-214ENST00000635950 2771 ntTSL 520.13■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-217ENST00000637060 3825 ntTSL 513.2□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-219ENST00000637464 4893 ntTSL 512.38□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-215ENST00000636509 3949 ntTSL 510.55□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP1-208ENST00000626416 3700 ntTSL 56.57□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 53.83□□□□□ -1.85e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB1A-205ENST00000494188 771 ntTSL 222.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 12e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CTNNA1-236ENST00000522792 2044 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 27.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 ZNF207-211ENST00000579810 979 ntTSL 58.61□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.472e-16■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-16■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 MAPRE3-207ENST00000481222 833 ntTSL 311.91□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 MAPRE3-205ENST00000474367 551 ntTSL 27.7□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 LDHB-204ENST00000450584 732 ntTSL 39.77□□□□□ -0.853e-22■■■■■ 27.1
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 515.97■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 513.38□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 CLDN1-201ENST00000295522 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 LDHA-209ENST00000478970 732 ntTSL 215.74■□□□□ 0.113e-11■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 27
IGF2BP1Q9NZI8 LYSMD3-204ENST00000509384 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 26.9
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