Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD3Q9NX63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD3Q9NX63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms