Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RTN4Q9NQC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN4Q9NQC3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms