Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOD2Q9HC29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOD2Q9HC29 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOD2Q9HC29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms